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南科大實施的培養模式是“通識+專業教育”模式。
南科大從辦學開始，就逐步實施“通識+專業教育”(1+3、2+2)的本科生培養模式。
本科生招生時按大類錄取，新生入學不分專業，強化通識教育，打好學科基礎。
學生在大一下學期(最晚在大二下學期)根據自身興趣和特長自由選擇專業，在“寬口徑、厚基礎”之上，優化專業教育，注重學科交叉。
南科大這一以學生為中心的培養模式很好地避免了考生填報志愿時的盲目性帶來的風險，真正做到讓學生通過親身體驗和學習了解不同專業的要求，就讀自己喜歡且擅長的專業。
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